На территории района сейчас находится станция «Коломенская» Замоскворецкой линии.

К 2022 году в районе Нагатинский Затон будут построены станции метро "Кленовый бульвар" и "Нагатинский затон" восточного участка Большой кольцевой линии метро, сообщает РИАМО со ссылкой на пресс-службу департамента строительства города.