В каждой ландшафтной зоне парка «Зарядье» будет создана собственная экосистема. Все растения и грунты подбирались с учётом естественных природных условий.
«Согласно изначальной концепции парка у нас было четыре типа природно-ландшафтных зон — тундра, лесная зона, которая делится на хвойные, широколиственные, пойменные леса и березовую рощу, а также луг и степь. К ним добавилось пространство под «стеклянной корой», где планируется высадить южные растения, характерные для экосистемы г. Сочи. Наша главная идея, полностью поддержанная мэром Сергеем Собяниным – создать в «Зарядье» абсолютно безбарьерную среду, то есть никаких заборов, бортовых камней и оград мы не увидим - будет реализована. Сами парковые дорожки будут иметь пиксельное мощение, которое плавно будет переходить из сплошного в разреженное, позволяя посетителям пройтись по траве. Вдоль дорожек высадят многолетники, устойчивые к вытаптыванию. Посадка растений началась этой весной и закончится по плану в августе», - рассказал Сергей Кузнецов.

Всего в «Зарядье» будут расти более 700 деревьев – дубы, липы, рябины, яблони, остролистные и серебристые клёны и черёмуха.
Площадь всех газонов парка, включая луг, составит более 26 тыс. кв.м.
В каждой зоне парка формировались свои грунты. Специально подобранные почвосмеси привозились баржами по Москве-реки, они позволят растениям прижиться и быстрее адаптироваться к новым условиям. Состав грунтов готовили специалисты Главного ботанического сада имени Н. В. Цицина, а также биологического факультета МГУ имени М. В. Ломоносова.